Der Vorstand setzt sich aus Zytopathologinnen und Zytopathologen sowie Zytotechnikerinnen und Zytotechnikern zusammen. Er besteht aus Vertreterinnen und Vertretern der Fachgruppe der Zytotechnikerinnen und Zytotechniker, der Fachgruppe der Ärztinnen und Ärzte mit zytologischer Tätigkeit und der Fachgruppe der Zytopathologinnen und Zytopathologen. Es ist der einzige kontinuierliche Prüfungsausschuss für die Höhere Fachprüfung zum Erwerb des Schwerpunktes Zytopathologie.
Die Präsidentin ist auch im Vorstand der Schweizerischen Gesellschaft für Pathologie vertreten.
Die Präsidentin und der Vizepräsident vertreten die Gesellschaft bei der European Federation of Cytological Societies (EFCS).
Ein Vorstandsmitglied vertritt die Gesellschaft im «European Advisory Committee of Cytotechnology» (EACC).
Die Zytologie ist auch in der Tarifkommission der SGPath durch Mitglieder der Gesellschaft vertreten.